Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PparaP23204 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PparaP23204 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PparaP23204 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms