Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb9P20615 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms