Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P20040 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P20040 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P20040 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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