Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfaP20033 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms