Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cox5bP19536 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms