Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms