Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f1P17208 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms