Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms