Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rb1P13405 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rb1P13405 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rb1P13405 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms