Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calb1P12658 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms