Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Tnp1P10856 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms