Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms