Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CatspereP0DP43 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms