Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1P09055 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms