Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Eb1P04230 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb1P04230 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms