Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01807 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01807 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01807 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01807 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms