Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01672 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01672 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01672 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01672 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms