Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01655 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01655 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01655 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01655 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01655 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01655 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01655 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01655 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms