Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01649 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01649 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01649 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms