Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01641 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01641 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01641 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01641 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01641 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01641 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01641 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01641 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01641 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01641 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01641 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01641 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01641 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.9 ms