Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3pxd2aO89032 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3pxd2aO89032 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms