Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShdO88834 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShdO88834 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ShdO88834 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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