Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms