Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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