Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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