Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3O54890 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms