Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkaO54804 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkaO54804 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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