Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DffaO54786 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DffaO54786 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DffaO54786 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DffaO54786 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DffaO54786 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DffaO54786 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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