Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdc4O35988 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms