Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms