Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pold2O35654 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms