Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edil3O35474 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms