Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TnxbO35452 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TnxbO35452 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TnxbO35452 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TnxbO35452 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TnxbO35452 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TnxbO35452 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms