Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms