Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd2O35392 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Foxd2O35392 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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