Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc1O35379 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc1O35379 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms