Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NmiO35309 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NmiO35309 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NmiO35309 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NmiO35309 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NmiO35309 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NmiO35309 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms