Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Scarb2O35114 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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