Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ArxO35085 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ArxO35085 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ArxO35085 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ArxO35085 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ArxO35085 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ArxO35085 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ArxO35085 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ArxO35085 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ArxO35085 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ArxO35085 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ArxO35085 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms