Protein–RNA interactions for Protein: O08811

Ercc2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc2O08811 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc2O08811 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc2O08811 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms