Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm20939L7N243 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20939L7N243 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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