Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alkal1J3QPP8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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