Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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