Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc180J3QNE4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms