Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3415J3QMS8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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