Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3336J3QMQ6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3336J3QMQ6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3336J3QMQ6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3336J3QMQ6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms