Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6594J3QM43 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms