Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem200cJ3QK46 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms