Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms