Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms